1.开机，检查仪器是否正常；
2.把反应板放进仪器系统中，盖上仪器盖子；
3.双击桌面上软件的图标，弹出软件操作界面；
4.选择实验应用类型(定量或基因分型或HRB)，检测染料(Sybr染料法或Taqman探针方法，起始模板(DNAOrRNA)；
5.如实验应用类型选择定量，再选择相应的定量方法(相对定量或标准曲线定量);
6.点击，完成建立一个新的实验;
7.点击 Plate Layout，弹出样品排布操作界面，进行样品排布，包括标准品(Standard)、样品(unknown)、阴性对照(NTC)等;
8.点击 Thermal Profile，弹出温度时间设置界面，进行反应温度和时间的设置:
9.设置完温度和时间，点击 Start Run 按键，开始反应。
10.反应结束，进行实验数据分析:
8.1 点击 Analyze Data，弹出数据分析操作界面，分别是:原始数据、扩增曲线熔解曲线(SYBR的方法)、结果:
8.2 基线自动设置:点击 Analysis Settings 按钮,分析设置对话框打开，选择 AutoBaseline，点击Apply;如需手动调整基线，在打开的分析设置对话框中，输入基线的起始循环和终止循环数，点击 Apply;
8.3 阈值自动设置:点击 Analysis Settings 按钮,分析设置对话框打开,选择 AutoThreshold，点击Apply;如需手动调整阀值，在打开的分析设置对话框中，输入阀值的具体数字，点击Apply;
8.4结果显示:Eco软件能根据实验设定的类型、基线和阀值自动分析实验数据产生结果图。
◆绝对定量:产生一个标准曲线，根据标准曲线给出未知样品的浓度，同时显示标准曲线斜率、PCR、扩增效率、R2;
◆相对定量:产生不同处理的基因表达高低的柱状图;
◆基因分型:根据基因的类型，产生散点图结果;
◆HRM 实验:产生熔解曲线图，可以通过标准熔解曲线或差异熔解曲线显示基因位点的差异。
