 
中医药科学院下设综合办公室、科教部、实验动物中心、公共实验技术中心以及各类研究所18个。公共实验技术中心下设分子生物学、细胞分析检测、组织形态检测、分析检测、创新药物与功能性食品制剂五大技术服务平台。
中医药科学院组织架构示意图
| 湖南中医药大学中医药科学院 | |||||||||||||||||||||
| 综合办公室 | 科教部 | 实验动物中心 | 公共实验技术中心 | 中医基础研究所 | 中医诊断研究所 | 中药资源研究所 | 中药制剂关键技术研究所 | 针灸推拿研究所 | 中药创新药物研究所 | 药食同源健康产品研究所 | 中医药精准医学研究所 | 中医药转化医学研究所 | 中西医结合(心脑血管)研究所 | 中医五官(眼科)研究所 | 中医肿瘤研究所 | 中医肝病研究所 | 中医外科(皮肤、肛肠)研究所 | 中医药生殖健康研究所 | 第一临床研究所 | 第二临床研究所 | 中医药文化传播和政策研究所 | 
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